В конце октября 2025 года «Яндекс Музыка» анонсировала выпуск своего первого официального десктопного приложения для платформы Linux. Доступный для загрузки DEB-пакет поддерживает версии Ubuntu 22.04 и выше, а также Debian 11 и выше. Ранее пользователи Linux были вынуждены использовать неофициальные версии приложения, созданные на основе Windows-клиента, адаптированного с помощью Electron.

Разработчик Максим Чингин ранее выпустил проект Yaamp, представляющий собой клон Winamp 2.91, который интегрирует «Яндекс Музыка» через yandex-music-api. Приложение Yaamp доступно для Windows, MacOS и Linux и распространяется под лицензией MIT.

В ноябре 2024 года команда «Яндекс Музыки» завершила бета-тестирование приложения для настольных ПК на Windows и macOS, добавив функции скачивания и синхронизации воспроизведения. Теперь пользователи могут выбрать один из трех режимов прослушивания: «Превосходное», «Оптимальное» и «Экономичное», в зависимости от скорости интернета. Режим «Превосходное» поддерживает Lossless и другие высококачественные форматы, идеально подходящие для акустических систем. Новое приложение также гарантирует плавный переход между устройствами, автоматически продолжая воспроизведение с того места, где пользователь остановился на мобильном устройстве.